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阿里云智能達(dá)摩院-新冠肺炎全基因組測(cè)序智能分析

來源:人工智能產(chǎn)業(yè)發(fā)展聯(lián)盟     編輯:創(chuàng)澤   時(shí)間:2020/6/11   主題:其他 [加盟]

抗疫期間所解決的業(yè)務(wù)需求

快速準(zhǔn)確的診斷新冠肺炎,并研究病毒基因組的演化,以便確定病毒的來源及傳播。

解決方案及特色

基因組檢測(cè)需要做到快速準(zhǔn)確,對(duì)海量測(cè)序數(shù)據(jù)做到快速分析需要強(qiáng)大的計(jì)算和存儲(chǔ)系統(tǒng)。依托阿里云強(qiáng)大的云平臺(tái),支持線上和本地化大數(shù)據(jù)套件部署。
基因組數(shù)據(jù)分析方面,主要提供并行、分布式的大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。功能包括序列質(zhì)控、序列比對(duì)、序列拼接。每個(gè)步驟經(jīng)過優(yōu)化設(shè)計(jì)和參數(shù)調(diào)優(yōu)使得對(duì)于 CPU 和內(nèi)存的利用更為高效,從而有效減少了數(shù)據(jù)分析的時(shí)間。此外,系統(tǒng)提供友好界面,并支持一鍵出分析報(bào)告功能。
除了病原體檢測(cè)之外,對(duì)于不同來源病原體的序列和結(jié)構(gòu)分析有助于實(shí)現(xiàn)病原體的朔源和對(duì)應(yīng)藥物分析。進(jìn)化分析以及基于深度學(xué)習(xí)的人工智能算法能夠加速并且精準(zhǔn)實(shí)現(xiàn)預(yù)期目的。
系統(tǒng)采用云架構(gòu),支持線上和用戶本地部署。配合阿里云專有云的 Iaas 和 Paas 系統(tǒng),快速搭建大數(shù)據(jù)平臺(tái)。該平臺(tái)采用分布式存儲(chǔ)和分布式計(jì)算系統(tǒng),有效解決基因測(cè)序數(shù)據(jù)量大,分析計(jì)算需要分布式或并行方式的特點(diǎn);谠摯髷(shù)據(jù)平臺(tái),分析速度能有效提升 4~10 倍,人工智能分析處理速度也大幅提升。

應(yīng)用與效果

全基因組測(cè)序技術(shù)在全國(guó)進(jìn)行應(yīng)用實(shí)踐。阿里達(dá)摩院在浙江省疾控中心和武漢金銀潭醫(yī)院做試點(diǎn)應(yīng)用,效果不錯(cuò),整體準(zhǔn)確率非常高。

產(chǎn)學(xué)研結(jié)合情況及效果

在我們的實(shí)際應(yīng)用中,該項(xiàng)技術(shù)整合了生物制藥企業(yè)、人工智能企業(yè)、醫(yī)療機(jī)構(gòu)、高校等各方技術(shù)力量,從試劑研發(fā)、數(shù)據(jù)分析、流程設(shè)計(jì)等多角度全方位的設(shè)計(jì)來改進(jìn)和完善技術(shù)。





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構(gòu)建基于多源信息融合的巷道網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)動(dòng)態(tài)演進(jìn)模型,實(shí)現(xiàn)應(yīng)急協(xié)同疏導(dǎo)路線動(dòng)態(tài)優(yōu)化及應(yīng)急協(xié)同疏導(dǎo)路線人員分流技術(shù),形成面向井下大規(guī)模人群的智能應(yīng)急導(dǎo)航軟件平臺(tái)

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開發(fā)了告警接收、處置安排及消警反饋的移動(dòng)智能巡檢終端及其APP應(yīng)用,融合人工智能、移動(dòng)應(yīng)用的可視化遠(yuǎn)程巡檢系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)隱患實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)、智能分析、預(yù)警推送和快速處置的全流程閉環(huán)

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